توالی شخصی می شود – مجله دانشمند آسیایی



آسیایی دانشمند (7 فوریه 2024)– پزشکی دقیق چشم انداز مراقبت های بهداشتی را آنطور که می شناسیم دگرگون کرده است. با انحراف از رویکرد معمولی یک اندازه مناسب برای همه، این رشته از داده های ژنتیکی خود بیمار برای تنظیم تشخیص و درمان با نیازهای منحصر به فرد آنها استفاده می کند.

چنین راه حل هایی از دنیای غنی و پیچیده تفاوت های ژنتیکی بین افراد سوء استفاده می کند. این امر با فناوری‌های توالی‌یابی نسل بعدی (NGS) امکان‌پذیر است، که محققان را قادر می‌سازد تا مشخصات ژنتیکی کامل بیماران را به سرعت و با هزینه کم توالی‌یابی کنند.

در خط مقدم پیشرفت فناوری های توالی یابی برای پزشکی دقیق، Twist Bioscience، یک رهبر جهانی در زیست شناسی مصنوعی و ژنومیک است. این شرکت با مجموعه گسترده ای از ابزارهای پیشرفته NGS، طیف گسترده ای از پروژه ها را از راه حل های کشاورزی تا تحقیقات سرطان را پیش برده است.

یکی از راه حل های نوآورانه Twist Bioscience مجموعه ای از پانل های غنی سازی هدف بسیار قابل تنظیم است – Twist Custom Panels. این پانل ها که به دقت برای هر پروژه طراحی شده اند، بهینه سازی ها و صرفه جویی بیشتری را در گردش کار NGS ارائه می کنند.

“با توجه به محدود بودن املاک و مستغلات یک سلول جریان، پانل های سفارشی امکان هدف گیری انتخابی مناطق خاص را فراهم می کنند تا محققان بتوانند مناطق مورد نظر را در عمق بیشتری مشاهده کنند که آزمایش های خود را مقیاس می کنند.” دکتر امیلی لپروست، مدیرعامل و یکی از بنیانگذاران Twist Bioscience توضیح داد که این امر باعث صرفه جویی در هزینه های توالی و قدرت محاسباتی می شود.

به گفته دکتر لپروست، پانل های سفارشی از فرآیندی عمدی برای غنی سازی مناطق خاصی از ژنوم استفاده می کنند. این کار با پروب‌های بیوتینیله دو رشته‌ای شروع می‌شود که برای اتصال خاص به مناطق هدف طراحی شده‌اند. سپس کاوشگرها و DNA هدف با هم توسط دانه های استرپتاویدین به پایین کشیده می شوند و آنها را از مناطق غیر هدف جدا می کنند. محصول نهایی یک کتابخانه DNA تصفیه شده است که عمدتاً از مناطق مورد نظر مورد نظر تشکیل شده است.

او افزود: «ما همچنین اخیراً شروع به ارائه پانل‌های ثبت RNA سفارشی کرده‌ایم که مبتنی بر رویکرد اختصاصی اگزون ما هستند که توسط هیچ‌کس دیگری در بازار ارائه نشده است.

پنل‌های Twist سفارشی که با دقت توسط الگوریتم‌های قوی Twist Bioscience طراحی شده‌اند، می‌توانند در عین حفظ پوشش یکنواخت در کل منطقه تعریف‌شده ژنوم، تصاویر بسیار خاصی از مناطق هدف را ارائه دهند. این با متعادل کردن استراتژیک پروب ها بر اساس محتوای GC آنها به دست می آید. علاوه بر این، پانل های سفارشی سنتز شده قبل از رسیدن به مشتریان، تحت روش های کنترل کیفیت دقیق مبتنی بر NGS قرار می گیرند.

دکتر لپروست گفت: «این فرآیند دقیق، ارائه داده‌های با کیفیت و قابل اعتماد را تضمین می‌کند، که به ویژه برای کاربردهای تشخیصی مانند تشخیص سرطان بسیار مهم است».

Twist Bioscience که متعهد به ارائه راه حل های جامع برای غنی سازی هدف است، خدمات دستکش سفید را نیز به عنوان بخشی از فرآیند طراحی پانل ارائه می دهد. یک تیم ویژه برای درک پروژه های مشتریان اعزام می شود و اطلاعات لازم برای طراحی پنل سفارشی را با دقت انتخاب می کند. چنین اطلاعاتی به الگوریتم‌های Twist Bioscience وارد می‌شود، که سپس پروب‌های DNA 120 جفت پایه را فرموله می‌کنند که قادر به گرفتن یکنواخت همه مناطق مورد نظر هستند.

برای ارائه انعطاف‌پذیری و سادگی بیشتر به گردش کار NGS، Twist Bioscience پانل‌های ترکیبی سفارشی Twist را معرفی کرده است و به مشتریان این امکان را می‌دهد که پانل‌های توالی‌بندی موجود را گسترش یا ارتقا دهند. با آزادی ترکیب و تطبیق از طیف متنوع پانل های Twist Bioscience، مشتریان اکنون می توانند ابزارهای مختلف را در یک پانل واحد ترکیب کنند تا با نیازهای تحقیقاتی یا تشخیصی خود مطابقت داشته باشند. علاوه بر این، به مشتریان در بهینه سازی ترکیب پانل ها کمک می شود.

دکتر لپروست به اشتراک گذاشت: “این پانل ها تحت کنترل کیفیت دقیق مشابه پانل های مرکب استاندارد قرار می گیرند، و به مشتریان اجازه می دهد تا به طور یکپارچه از آنها به عنوان یک پانل واحد در طول گردش کار غنی سازی هدفمند استفاده کنند.”

از زمان معرفی آن به بازار، مناطق تحقیقاتی بی‌شماری از پانل‌های Twist سفارشی بهره‌مند شده‌اند که نمونه‌برداری مایع و تشخیص سرطان به برخی از محبوب‌ترین کاربردهای این فناوری تبدیل شده‌اند. یک مطالعه اخیر یک پانل متیلوم شخصی برای تشخیص زودهنگام سرطان کولورکتال ایجاد کرد. این پانل که برای گرفتن سیگنال های متیلاسیون DNA طراحی شده است، برای غربالگری بیماران از نظر الگوهای بیان DNA نشان دهنده بیماری استفاده شده است.

دکتر لپروست گفت: “ما پانل های سفارشی را برای طیف گسترده ای از کاربردها، از جمله سرطان شناسی، تشخیص متیلاسیون، ژنتیک جمعیت، غربالگری ناقلین و کشاورزی طراحی می کنیم.”

در حالی که چنین قابلیت کاربردی فوق العاده ای در دنیای واقعی یک ویژگی بسیار جذاب برای محققان و پزشکان است، سهولت و کارایی سفارشی سازی است که واقعاً به پانل های Twist Bioscience برتری رقابتی می دهد.

به لطف قابلیت‌های سنتز کاوشگر سریع ما، مشتریان می‌توانند پنل‌های آزمایشی را ظرف چهار تا شش هفته سفارش داده و آزمایش کنند. پس از رضایت، آنها می توانند به طور یکپارچه به مقیاس تولید تنها در هشت هفته حرکت کنند. این ترکیب منحصر به فرد مقیاس پذیری و سرعت سفارشی سازی، Twist Bioscience را از بقیه متمایز می کند.

پانل های سفارشی Twist نشان دهنده تعهد طولانی مدت Twist Bioscience به ارائه سریع راه حل های حساس، مقیاس پذیر و با کیفیت برای غنی سازی هدف است. این پانل‌ها با صرفه‌جویی قابل توجه در زمان و هزینه، راه‌حل طولانی‌مدت پایداری را در اختیار محققان و پزشکان قرار می‌دهند، زیرا حوزه پزشکی به سمت درمان‌ها و تشخیص‌های شخصی تغییر می‌کند.

با Twist Bioscience تماس بگیرید و در مورد راه حل های غنی سازی هدف سفارشی آنها در اینجا بیشتر بیاموزید.


منبع: Twist Bioscience; Connect World/Shutterstock
سلب مسئولیت: این مقاله لزوماً منعکس کننده نظرات AsianScientist یا کارکنان آن نیست.



دیدگاهتان را بنویسید